MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 16108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012796	C	7	7	9	15	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_012796	TCG	2	6	24	29	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012796	CAC	2	6	91	96	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012796	CGC	2	6	1472	1477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012796	CGGT	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012796	T	8	8	1520	1527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012796	T	7	7	1605	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012796	AGA	2	6	1626	1631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012796	GCC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012796	GCGCC	2	10	1804	1813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012796	GC	3	6	1816	1821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012796	AGG	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012796	AAGA	2	8	13019	13026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012796	CG	3	6	13033	13038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012796	CAAGA	2	10	13045	13054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012796	CAAT	2	8	13056	13063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012796	T	7	7	13087	13093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012796	CTA	2	6	15092	15097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012796	GC	3	6	15474	15479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012796	ATC	2	6	15485	15490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012796	A	6	6	16310	16315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012796	T	6	6	16335	16340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012796	CTTGG	2	10	16806	16815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012796	A	8	8	16846	16853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012796	CGACA	2	10	22464	22473	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012796	CAA	2	6	23141	23146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012796	A	6	6	23145	23150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012796	G	6	6	24528	24533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012796	GCC	2	6	24555	24560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012796	TCT	2	6	24568	24573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012796	GCCG	2	8	25626	25633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012796	GCTC	2	8	28180	28187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012796	GAA	2	6	28219	28224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012796	CGG	2	6	28235	28240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012796	G	6	6	29541	29546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012796	ATC	2	6	29547	29552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012796	C	6	6	29552	29557	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_012796	A	6	6	29666	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012796	TGGAAT	2	12	33009	33020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012796	A	6	6	35383	35388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012796	T	6	6	35399	35404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012796	A	7	7	35408	35414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012796	GTC	2	6	35474	35479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012796	TTC	2	6	35486	35491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012796	CTT	2	6	35549	35554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012796	CGC	2	6	35557	35562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012796	AGG	2	6	35563	35568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012796	CGG	2	6	36687	36692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012796	C	6	6	36715	36720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_012796	CGT	2	6	38958	38963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012796	ATT	2	6	38987	38992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012796	GGCGT	2	10	39108	39117	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012796	CGG	2	6	39146	39151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012796	CGG	2	6	39517	39522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012796	CGC	2	6	39571	39576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012796	CCTG	2	8	39580	39587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012796	GGA	2	6	43226	43231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012796	A	6	6	43244	43249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012796	TCC	2	6	43256	43261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012796	GCT	2	6	43271	43276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012796	CGG	2	6	43322	43327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012796	GCC	2	6	43343	43348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012796	G	6	6	43358	43363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012796	GCC	2	6	43385	43390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_012796	TCT	2	6	43398	43403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012796	GCC	2	6	44834	44839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012796	GCG	2	6	44842	44847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012796	CAT	2	6	44868	44873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012796	AC	3	6	44874	44879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012796	CACGA	2	10	44890	44899	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012796	CGG	2	6	44927	44932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012796	T	7	7	46417	46423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012796	T	6	6	46590	46595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012796	CATGG	2	10	46600	46609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_012796	TCA	2	6	46623	46628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012796	A	8	8	46636	46643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012796	TAAA	2	8	46665	46672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012796	CAA	2	6	46699	46704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012796	AGC	2	6	46711	46716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012796	ACCG	2	8	47179	47186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012796	T	6	6	47206	47211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012796	TCG	2	6	47230	47235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012796	C	7	7	47251	47257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_012796	CCCA	2	8	47283	47290	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_012796	CGC	2	6	47293	47298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012796	AG	3	6	49820	49825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012796	TCG	2	6	49833	49838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012796	G	6	6	49865	49870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012796	GCC	2	6	49892	49897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012796	TCC	2	6	50997	51002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012796	CGGCG	2	10	51035	51044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012796	GGGGA	2	10	51110	51119	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012796	GGC	2	6	51155	51160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012796	CGG	2	6	51195	51200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012796	CGG	2	6	51214	51219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012796	GCC	2	6	51235	51240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_012796	CGCC	2	8	52006	52013	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_012796	CTGCC	2	10	52014	52023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_012796	GCC	3	9	52047	52055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012796	GCCCA	2	10	52072	52081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_012796	GCC	2	6	52083	52088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012796	GCC	2	6	52141	52146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012796	CCG	2	6	52161	52166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012796	C	6	6	52167	52172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_012796	G	6	6	52192	52197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012796	GCC	2	6	52219	52224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012796	CAA	2	6	52532	52537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012796	AGC	2	6	52539	52544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012796	CGA	2	6	52552	52557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012796	GAA	2	6	53275	53280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012796	GAC	2	6	53284	53289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012796	GGC	2	6	53455	53460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012796	CGA	2	6	54426	54431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012796	G	6	6	54477	54482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012796	GCC	2	6	54504	54509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012796	TCT	2	6	54523	54528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012796	GCC	2	6	55179	55184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012796	CTC	2	6	55185	55190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012796	CG	3	6	55675	55680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012796	CAA	2	6	55693	55698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012796	GC	3	6	55747	55752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012796	CGC	2	6	55826	55831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012796	CAA	2	6	56676	56681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012796	GC	3	6	56698	56703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012796	GCG	2	6	56722	56727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012796	CA	3	6	56758	56763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012796	ACG	2	6	56764	56769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012796	CCG	2	6	57296	57301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012796	CGC	2	6	57318	57323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012796	CGG	2	6	57333	57338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012796	CAA	2	6	57341	57346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012796	A	6	6	57345	57350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012796	CGC	2	6	57429	57434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012796	CGG	2	6	57445	57450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012796	GGA	2	6	58524	58529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012796	A	6	6	58542	58547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012796	TTCC	2	8	58553	58560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012796	CCT	2	6	58569	58574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012796	G	6	6	58594	58599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012796	AG	3	6	58651	58656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012796	GCC	2	6	58677	58682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_012796	G	6	6	58726	58731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012796	ATC	2	6	58732	58737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012796	C	6	6	58737	58742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_012796	GCC	2	6	58778	58783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_012796	TCAC	2	8	58797	58804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012796	GAT	2	6	63165	63170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012796	GGCG	2	8	63208	63215	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_012796	GCC	2	6	71285	71290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_012796	C	6	6	74374	74379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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332	NC_012796	GTG	2	6	111339	111344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_012796	A	8	8	111522	111529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_012796	GTT	2	6	128988	128993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_012796	GGC	2	6	129018	129023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_012796	CGAA	2	8	129050	129057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
437	NC_012796	TAA	2	6	129204	129209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012796	TTCA	2	8	129244	129251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
439	NC_012796	TTAT	2	8	129280	129287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_012796	CTA	2	6	129308	129313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_012796	CAA	2	6	129565	129570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_012796	GCT	2	6	129581	129586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_012796	TGGCA	2	10	129628	129637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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447	NC_012796	TGTTT	2	10	129770	129779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_012796	T	7	7	133318	133324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012796	A	6	6	134659	134664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012796	CTG	2	6	135101	135106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_012796	T	7	7	135269	135275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_012796	CTTC	2	8	136501	136508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_012796	A	6	6	140249	140254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_012796	CTTT	2	8	140380	140387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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460	NC_012796	CGA	2	6	140473	140478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_012796	CAG	2	6	140489	140494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_012796	TTCT	2	8	141223	141230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_012796	TCG	2	6	141304	141309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_012796	GCT	2	6	141310	141315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_012796	CAA	2	6	141330	141335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_012796	CAC	2	6	141345	141350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_012796	AGG	2	6	141935	141940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012796	T	6	6	142548	142553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012796	CCG	2	6	142637	142642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
473	NC_012796	TAT	2	6	142644	142649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_012796	GCC	2	6	143701	143706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
475	NC_012796	TTTTCT	2	12	143719	143730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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479	NC_012796	TCA	2	6	144131	144136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_012796	GGT	2	6	144953	144958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
481	NC_012796	CTG	2	6	144979	144984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_012796	TGGC	2	8	145033	145040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_012796	GCCA	2	8	145122	145129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_012796	GGA	2	6	145145	145150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_012796	GGC	2	6	145274	145279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_012796	GGC	2	6	145352	145357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_012796	C	6	6	145373	145378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
492	NC_012796	GCG	2	6	145431	145436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_012796	GCAA	2	8	145541	145548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_012796	GAAG	2	8	145549	145556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_012796	TTTTC	2	10	145561	145570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_012796	G	6	6	150025	150030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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